Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.1 ms