Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Gm6606-201ENSMUST00000193613 947 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Gm14055-201ENSMUST00000130262 668 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Gm23675-201ENSMUST00000157311 125 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 AI839979-201ENSMUST00000200738 654 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Gm20735-202ENSMUST00000212387 519 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Gm12461-201ENSMUST00000120231 1239 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Gm6564-201ENSMUST00000075377 619 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms