Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms