Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Gm37234-201ENSMUST00000193259 1441 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 AC242269.1-201ENSMUST00000227020 741 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Clec4a2-201ENSMUST00000032248 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Hormad1-204ENSMUST00000171191 1437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Vmn1r-ps28-201ENSMUST00000174767 942 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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Tsr1Q5SWD9 Gm37468-201ENSMUST00000194767 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Tsr1Q5SWD9 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Gm35189-201ENSMUST00000219319 789 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 AC163038.1-201ENSMUST00000223632 1142 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Ptma-201ENSMUST00000045897 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Vmn1r67-201ENSMUST00000055964 999 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Olfr921-201ENSMUST00000071681 1181 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Olfr547-201ENSMUST00000098229 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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