Protein–RNA interactions for Protein: Q499D0

Foxn3, Forkhead box protein N3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn3Q499D0 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxn3Q499D0 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms