Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Usp48Q3V0C5 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Usp48Q3V0C5 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Usp48Q3V0C5 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Usp48Q3V0C5 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Usp48Q3V0C5 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Usp48Q3V0C5 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Usp48Q3V0C5 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Usp48Q3V0C5 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Usp48Q3V0C5 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp48Q3V0C5 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp48Q3V0C5 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp48Q3V0C5 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp48Q3V0C5 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp48Q3V0C5 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp48Q3V0C5 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp48Q3V0C5 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp48Q3V0C5 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp48Q3V0C5 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp48Q3V0C5 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp48Q3V0C5 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp48Q3V0C5 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp48Q3V0C5 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp48Q3V0C5 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp48Q3V0C5 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp48Q3V0C5 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp48Q3V0C5 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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