Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Gm6047-201ENSMUST00000167221 574 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Olfr1153-201ENSMUST00000052300 957 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Olfr19-201ENSMUST00000057886 1142 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Mir1192-201ENSMUST00000116976 121 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Gm12073-201ENSMUST00000117382 524 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Gm25295-201ENSMUST00000122794 306 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 4930486I03Rik-201ENSMUST00000161509 788 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Gm6098-201ENSMUST00000180234 330 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Gm29036-201ENSMUST00000189967 877 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Gm7967-201ENSMUST00000190991 399 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 4930533L02Rik-201ENSMUST00000194425 1160 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Il6-204ENSMUST00000199765 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Gm43263-201ENSMUST00000201619 560 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Olfr510-201ENSMUST00000076289 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms