Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Poc1a-209ENSMUST00000216228 1431 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 AC137950.2-202ENSMUST00000227150 1635 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Gm13700-201ENSMUST00000118624 1128 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Gm17796-201ENSMUST00000189015 1213 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 AC140409.3-201ENSMUST00000215601 358 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Tex101-201ENSMUST00000078001 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Gm37782-201ENSMUST00000194879 678 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Gm20735-202ENSMUST00000212387 519 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Abracl-203ENSMUST00000218994 425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms