Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Rnf149Q3U2C5 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Rnf149Q3U2C5 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Rnf149Q3U2C5 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Rnf149Q3U2C5 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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