Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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