Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Usp39Q3TIX9 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Usp39Q3TIX9 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Usp39Q3TIX9 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Usp39Q3TIX9 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Usp39Q3TIX9 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Usp39Q3TIX9 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Usp39Q3TIX9 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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