Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Abca9-201ENSMUST00000044850 6384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Ipo7-201ENSMUST00000084731 4763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms