Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

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Length 1,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms