Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MitfQ08874 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MitfQ08874 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MitfQ08874 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MitfQ08874 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MitfQ08874 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MitfQ08874 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
MitfQ08874 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
MitfQ08874 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MitfQ08874 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MitfQ08874 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms