Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SeleQ00690 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
SeleQ00690 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SeleQ00690 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
SeleQ00690 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SeleQ00690 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
SeleQ00690 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SeleQ00690 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SeleQ00690 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SeleQ00690 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SeleQ00690 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SeleQ00690 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SeleQ00690 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SeleQ00690 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SeleQ00690 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
SeleQ00690 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SeleQ00690 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SeleQ00690 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SeleQ00690 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SeleQ00690 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SeleQ00690 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SeleQ00690 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
SeleQ00690 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SeleQ00690 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SeleQ00690 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SeleQ00690 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SeleQ00690 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SeleQ00690 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SeleQ00690 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SeleQ00690 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SeleQ00690 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SeleQ00690 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SeleQ00690 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SeleQ00690 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
SeleQ00690 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SeleQ00690 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SeleQ00690 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SeleQ00690 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SeleQ00690 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
SeleQ00690 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SeleQ00690 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SeleQ00690 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SeleQ00690 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
SeleQ00690 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
SeleQ00690 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SeleQ00690 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SeleQ00690 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SeleQ00690 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SeleQ00690 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SeleQ00690 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SeleQ00690 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SeleQ00690 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SeleQ00690 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SeleQ00690 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SeleQ00690 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SeleQ00690 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SeleQ00690 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SeleQ00690 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SeleQ00690 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SeleQ00690 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SeleQ00690 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SeleQ00690 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SeleQ00690 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SeleQ00690 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SeleQ00690 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SeleQ00690 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
SeleQ00690 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
SeleQ00690 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
SeleQ00690 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.84
SeleQ00690 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
SeleQ00690 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC9.77□□□□□ -0.84
SeleQ00690 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
SeleQ00690 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
SeleQ00690 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
SeleQ00690 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
SeleQ00690 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
SeleQ00690 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
SeleQ00690 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
SeleQ00690 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms