Protein–RNA interactions for Protein: P98156

Vldlr, Very low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VldlrP98156 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VldlrP98156 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
VldlrP98156 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
VldlrP98156 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
VldlrP98156 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
VldlrP98156 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VldlrP98156 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
VldlrP98156 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VldlrP98156 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VldlrP98156 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
VldlrP98156 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VldlrP98156 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VldlrP98156 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
VldlrP98156 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VldlrP98156 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VldlrP98156 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VldlrP98156 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VldlrP98156 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VldlrP98156 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VldlrP98156 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VldlrP98156 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
VldlrP98156 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VldlrP98156 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VldlrP98156 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VldlrP98156 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VldlrP98156 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VldlrP98156 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VldlrP98156 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VldlrP98156 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VldlrP98156 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VldlrP98156 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
VldlrP98156 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VldlrP98156 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VldlrP98156 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VldlrP98156 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VldlrP98156 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VldlrP98156 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VldlrP98156 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VldlrP98156 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VldlrP98156 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VldlrP98156 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VldlrP98156 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VldlrP98156 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VldlrP98156 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VldlrP98156 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
VldlrP98156 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VldlrP98156 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
VldlrP98156 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VldlrP98156 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VldlrP98156 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VldlrP98156 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VldlrP98156 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VldlrP98156 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VldlrP98156 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VldlrP98156 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VldlrP98156 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VldlrP98156 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VldlrP98156 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VldlrP98156 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VldlrP98156 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VldlrP98156 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VldlrP98156 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
VldlrP98156 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
VldlrP98156 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
VldlrP98156 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VldlrP98156 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VldlrP98156 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VldlrP98156 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VldlrP98156 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VldlrP98156 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VldlrP98156 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VldlrP98156 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VldlrP98156 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VldlrP98156 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VldlrP98156 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VldlrP98156 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VldlrP98156 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VldlrP98156 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VldlrP98156 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VldlrP98156 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VldlrP98156 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VldlrP98156 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VldlrP98156 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VldlrP98156 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VldlrP98156 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VldlrP98156 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VldlrP98156 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VldlrP98156 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VldlrP98156 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VldlrP98156 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VldlrP98156 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VldlrP98156 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VldlrP98156 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VldlrP98156 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VldlrP98156 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VldlrP98156 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VldlrP98156 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
VldlrP98156 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VldlrP98156 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VldlrP98156 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms