Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx2P80206 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx2P80206 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx2P80206 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx2P80206 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx2P80206 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx2P80206 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx2P80206 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx2P80206 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx2P80206 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx2P80206 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx2P80206 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms