Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Acta1P68134 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Acta1P68134 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Acta1P68134 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Acta1P68134 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acta1P68134 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Acta1P68134 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acta1P68134 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Acta1P68134 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acta1P68134 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Acta1P68134 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acta1P68134 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Acta1P68134 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms