Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P58686 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P58686 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P58686 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P58686 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P58686 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P58686 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P58686 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
P58686 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P58686 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
P58686 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P58686 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P58686 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P58686 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P58686 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
P58686 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P58686 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
P58686 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P58686 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
P58686 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P58686 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P58686 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P58686 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P58686 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P58686 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P58686 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P58686 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P58686 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P58686 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
P58686 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P58686 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P58686 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P58686 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P58686 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P58686 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P58686 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P58686 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P58686 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
P58686 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P58686 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P58686 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P58686 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P58686 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P58686 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P58686 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P58686 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P58686 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P58686 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P58686 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P58686 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P58686 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P58686 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P58686 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P58686 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P58686 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P58686 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P58686 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P58686 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P58686 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P58686 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P58686 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P58686 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P58686 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P58686 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P58686 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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P58686 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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P58686 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P58686 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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P58686 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P58686 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P58686 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P58686 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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P58686 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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P58686 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P58686 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P58686 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P58686 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P58686 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P58686 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P58686 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P58686 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P58686 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P58686 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P58686 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P58686 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P58686 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P58686 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P58686 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P58686 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P58686 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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