Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TtlP38585 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TtlP38585 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TtlP38585 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TtlP38585 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TtlP38585 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
TtlP38585 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TtlP38585 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TtlP38585 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TtlP38585 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TtlP38585 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TtlP38585 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TtlP38585 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TtlP38585 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TtlP38585 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
TtlP38585 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TtlP38585 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TtlP38585 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
TtlP38585 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TtlP38585 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
TtlP38585 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TtlP38585 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TtlP38585 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TtlP38585 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TtlP38585 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TtlP38585 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TtlP38585 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TtlP38585 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TtlP38585 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TtlP38585 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TtlP38585 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TtlP38585 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TtlP38585 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TtlP38585 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
TtlP38585 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TtlP38585 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TtlP38585 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TtlP38585 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TtlP38585 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TtlP38585 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TtlP38585 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TtlP38585 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TtlP38585 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TtlP38585 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TtlP38585 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TtlP38585 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TtlP38585 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TtlP38585 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TtlP38585 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TtlP38585 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TtlP38585 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TtlP38585 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TtlP38585 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TtlP38585 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TtlP38585 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TtlP38585 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TtlP38585 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
TtlP38585 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
TtlP38585 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TtlP38585 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TtlP38585 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TtlP38585 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
TtlP38585 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TtlP38585 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TtlP38585 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
TtlP38585 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TtlP38585 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TtlP38585 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TtlP38585 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TtlP38585 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TtlP38585 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TtlP38585 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TtlP38585 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TtlP38585 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TtlP38585 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TtlP38585 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TtlP38585 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TtlP38585 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TtlP38585 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TtlP38585 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TtlP38585 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TtlP38585 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TtlP38585 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TtlP38585 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TtlP38585 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TtlP38585 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TtlP38585 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TtlP38585 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TtlP38585 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TtlP38585 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TtlP38585 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TtlP38585 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TtlP38585 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TtlP38585 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TtlP38585 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TtlP38585 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TtlP38585 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TtlP38585 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TtlP38585 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TtlP38585 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms