Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

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Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gm29223-201ENSMUST00000188867 695 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Gm37921-201ENSMUST00000194333 695 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprkP35822 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprkP35822 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Tprkb-204ENSMUST00000113752 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Gm12676-201ENSMUST00000149078 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Pitpnm2os2-201ENSMUST00000159053 828 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Gm7627-201ENSMUST00000183205 999 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprkP35822 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprkP35822 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprkP35822 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprkP35822 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Gm829-201ENSMUST00000123741 465 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Gm4462-201ENSMUST00000166453 492 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Gm18123-201ENSMUST00000210874 822 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Abracl-203ENSMUST00000218994 425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Atp5s-204ENSMUST00000220916 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprkP35822 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprkP35822 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprkP35822 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprkP35822 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprkP35822 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprkP35822 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprkP35822 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprkP35822 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprkP35822 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprkP35822 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprkP35822 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprkP35822 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprkP35822 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprkP35822 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprkP35822 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprkP35822 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprkP35822 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprkP35822 Gm16305-201ENSMUST00000140747 556 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprkP35822 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprkP35822 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprkP35822 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprkP35822 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprkP35822 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprkP35822 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprkP35822 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprkP35822 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprkP35822 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprkP35822 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprkP35822 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprkP35822 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprkP35822 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprkP35822 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprkP35822 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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