Protein–RNA interactions for Protein: P31316

Gsx2, GS homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsx2P31316 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx2P31316 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx2P31316 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx2P31316 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx2P31316 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx2P31316 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx2P31316 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx2P31316 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx2P31316 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx2P31316 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx2P31316 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx2P31316 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx2P31316 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx2P31316 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx2P31316 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx2P31316 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx2P31316 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx2P31316 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx2P31316 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx2P31316 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx2P31316 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx2P31316 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx2P31316 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx2P31316 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx2P31316 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx2P31316 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx2P31316 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx2P31316 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx2P31316 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx2P31316 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx2P31316 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx2P31316 Olfr967-202ENSMUST00000213358 1210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx2P31316 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx2P31316 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx2P31316 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx2P31316 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx2P31316 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx2P31316 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx2P31316 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx2P31316 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx2P31316 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx2P31316 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx2P31316 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx2P31316 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx2P31316 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx2P31316 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx2P31316 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx2P31316 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx2P31316 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx2P31316 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx2P31316 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx2P31316 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx2P31316 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Gsx2P31316 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gsx2P31316 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gsx2P31316 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gsx2P31316 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gsx2P31316 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gsx2P31316 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gsx2P31316 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gsx2P31316 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gsx2P31316 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gsx2P31316 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gsx2P31316 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gsx2P31316 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gsx2P31316 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gsx2P31316 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gsx2P31316 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gsx2P31316 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gsx2P31316 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gsx2P31316 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gsx2P31316 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gsx2P31316 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gsx2P31316 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gsx2P31316 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gsx2P31316 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gsx2P31316 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gsx2P31316 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gsx2P31316 Gm24541-201ENSMUST00000103871 96 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gsx2P31316 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gsx2P31316 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gsx2P31316 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gsx2P31316 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gsx2P31316 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gsx2P31316 Gm5726-201ENSMUST00000173886 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gsx2P31316 Gm8677-201ENSMUST00000174637 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gsx2P31316 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gsx2P31316 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gsx2P31316 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gsx2P31316 Gm28195-201ENSMUST00000186992 372 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gsx2P31316 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gsx2P31316 Gm45276-201ENSMUST00000209549 1086 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gsx2P31316 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gsx2P31316 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gsx2P31316 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gsx2P31316 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gsx2P31316 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gsx2P31316 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gsx2P31316 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gsx2P31316 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.8 ms