Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms