Protein–RNA interactions for Protein: P28033

Cebpb, CCAAT/enhancer-binding protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpbP28033 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CebpbP28033 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CebpbP28033 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CebpbP28033 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CebpbP28033 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
CebpbP28033 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
CebpbP28033 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.63
CebpbP28033 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
CebpbP28033 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
CebpbP28033 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
CebpbP28033 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
CebpbP28033 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CebpbP28033 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CebpbP28033 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CebpbP28033 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CebpbP28033 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CebpbP28033 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CebpbP28033 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CebpbP28033 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CebpbP28033 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CebpbP28033 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CebpbP28033 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CebpbP28033 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CebpbP28033 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CebpbP28033 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CebpbP28033 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CebpbP28033 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CebpbP28033 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CebpbP28033 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CebpbP28033 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CebpbP28033 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
CebpbP28033 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
CebpbP28033 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
CebpbP28033 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
CebpbP28033 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CebpbP28033 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CebpbP28033 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CebpbP28033 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CebpbP28033 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CebpbP28033 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CebpbP28033 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CebpbP28033 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CebpbP28033 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CebpbP28033 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CebpbP28033 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CebpbP28033 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CebpbP28033 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CebpbP28033 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CebpbP28033 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CebpbP28033 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CebpbP28033 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CebpbP28033 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CebpbP28033 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CebpbP28033 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CebpbP28033 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CebpbP28033 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CebpbP28033 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CebpbP28033 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CebpbP28033 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CebpbP28033 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CebpbP28033 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CebpbP28033 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CebpbP28033 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CebpbP28033 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CebpbP28033 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CebpbP28033 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CebpbP28033 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CebpbP28033 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CebpbP28033 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CebpbP28033 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CebpbP28033 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CebpbP28033 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CebpbP28033 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CebpbP28033 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CebpbP28033 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CebpbP28033 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CebpbP28033 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CebpbP28033 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CebpbP28033 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CebpbP28033 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CebpbP28033 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CebpbP28033 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CebpbP28033 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CebpbP28033 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CebpbP28033 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CebpbP28033 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CebpbP28033 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CebpbP28033 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CebpbP28033 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CebpbP28033 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CebpbP28033 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CebpbP28033 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CebpbP28033 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CebpbP28033 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CebpbP28033 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CebpbP28033 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CebpbP28033 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CebpbP28033 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CebpbP28033 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CebpbP28033 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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