Protein–RNA interactions for Protein: P25425

Pou2f1, POU domain, class 2, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou2f1P25425 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 8030423F21Rik-201ENSMUST00000064097 2851 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 Adat1-201ENSMUST00000034427 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou2f1P25425 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms