Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RarbP22605 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RarbP22605 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RarbP22605 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RarbP22605 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RarbP22605 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RarbP22605 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RarbP22605 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RarbP22605 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RarbP22605 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RarbP22605 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RarbP22605 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RarbP22605 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RarbP22605 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RarbP22605 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RarbP22605 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RarbP22605 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RarbP22605 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RarbP22605 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RarbP22605 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RarbP22605 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RarbP22605 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RarbP22605 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RarbP22605 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RarbP22605 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RarbP22605 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RarbP22605 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RarbP22605 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RarbP22605 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RarbP22605 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RarbP22605 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RarbP22605 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RarbP22605 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RarbP22605 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RarbP22605 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RarbP22605 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RarbP22605 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RarbP22605 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RarbP22605 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RarbP22605 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RarbP22605 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RarbP22605 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RarbP22605 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RarbP22605 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
RarbP22605 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RarbP22605 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RarbP22605 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RarbP22605 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RarbP22605 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RarbP22605 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RarbP22605 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RarbP22605 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RarbP22605 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RarbP22605 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RarbP22605 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RarbP22605 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RarbP22605 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RarbP22605 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RarbP22605 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RarbP22605 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RarbP22605 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RarbP22605 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RarbP22605 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RarbP22605 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RarbP22605 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
RarbP22605 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RarbP22605 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RarbP22605 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RarbP22605 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
RarbP22605 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
RarbP22605 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RarbP22605 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RarbP22605 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
RarbP22605 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RarbP22605 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RarbP22605 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RarbP22605 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RarbP22605 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RarbP22605 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RarbP22605 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RarbP22605 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RarbP22605 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RarbP22605 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RarbP22605 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RarbP22605 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RarbP22605 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RarbP22605 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RarbP22605 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RarbP22605 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RarbP22605 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RarbP22605 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RarbP22605 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RarbP22605 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RarbP22605 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RarbP22605 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RarbP22605 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RarbP22605 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RarbP22605 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RarbP22605 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RarbP22605 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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