Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Fcer1aP20489 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Fcer1aP20489 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Fcer1aP20489 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Fcer1aP20489 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Fcer1aP20489 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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