Protein–RNA interactions for Protein: P18532

Ig heavy chain V region 1B43, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18532 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18532 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18532 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18532 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18532 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18532 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18532 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18532 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18532 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18532 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18532 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18532 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18532 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P18532 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18532 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18532 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18532 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18532 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18532 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18532 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18532 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18532 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18532 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18532 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18532 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18532 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18532 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18532 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18532 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18532 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18532 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18532 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18532 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18532 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18532 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18532 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18532 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18532 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18532 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18532 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18532 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18532 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18532 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18532 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P18532 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18532 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P18532 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P18532 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P18532 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18532 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18532 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P18532 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18532 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18532 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18532 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18532 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18532 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18532 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18532 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18532 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18532 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18532 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
P18532 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18532 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18532 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18532 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18532 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18532 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
P18532 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18532 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18532 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18532 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18532 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18532 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18532 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18532 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18532 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18532 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18532 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18532 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18532 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18532 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18532 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18532 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18532 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18532 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P18532 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18532 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18532 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P18532 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18532 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18532 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18532 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18532 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18532 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18532 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18532 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P18532 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P18532 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P18532 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms