Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Brpf1-208ENSMUST00000203577 4468 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gm26875-201ENSMUST00000181006 950 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms