Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Eb1P04230 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Eb1P04230 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Eb1P04230 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Eb1P04230 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Eb1P04230 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Eb1P04230 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Eb1P04230 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Eb1P04230 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Eb1P04230 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Eb1P04230 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Eb1P04230 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Eb1P04230 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Eb1P04230 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Eb1P04230 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Eb1P04230 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Eb1P04230 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Eb1P04230 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Eb1P04230 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Eb1P04230 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Eb1P04230 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78 ms