Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcnkO88874 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcnkO88874 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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CcnkO88874 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
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CcnkO88874 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcnkO88874 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcnkO88874 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CcnkO88874 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcnkO88874 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CcnkO88874 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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