Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Gm21976J3QNN2 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Gm21976J3QNN2 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Gm21976J3QNN2 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Gm21976J3QNN2 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Gm21976J3QNN2 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm21976J3QNN2 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm21976J3QNN2 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm21976J3QNN2 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm21976J3QNN2 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm21976J3QNN2 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm21976J3QNN2 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm21976J3QNN2 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm21976J3QNN2 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm21976J3QNN2 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm21976J3QNN2 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm21976J3QNN2 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21976J3QNN2 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21976J3QNN2 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21976J3QNN2 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21976J3QNN2 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21976J3QNN2 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21976J3QNN2 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21976J3QNN2 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21976J3QNN2 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21976J3QNN2 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21976J3QNN2 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21976J3QNN2 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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