Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
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Ccdc180J3QNE4 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
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