Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms