Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
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Rnf217D3YYI7 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Gm45696-201ENSMUST00000212088 985 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
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Rnf217D3YYI7 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Rnf217D3YYI7 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Cd59a-201ENSMUST00000040423 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Rnf217D3YYI7 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Rnf217D3YYI7 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Rnf217D3YYI7 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
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Rnf217D3YYI7 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
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