Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms