Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms