Protein–RNA interactions for Protein: Q9R061

Nubp2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, mousemouse

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nubp2Q9R061 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
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