Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC6

Tef, Thyrotroph embryonic factor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefQ9JLC6 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TefQ9JLC6 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TefQ9JLC6 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TefQ9JLC6 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TefQ9JLC6 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TefQ9JLC6 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
TefQ9JLC6 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TefQ9JLC6 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TefQ9JLC6 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TefQ9JLC6 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TefQ9JLC6 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TefQ9JLC6 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TefQ9JLC6 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TefQ9JLC6 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TefQ9JLC6 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TefQ9JLC6 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TefQ9JLC6 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TefQ9JLC6 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TefQ9JLC6 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TefQ9JLC6 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TefQ9JLC6 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TefQ9JLC6 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TefQ9JLC6 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms