Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms