Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Gm10580-201ENSMUST00000097985 396 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Gm10582-201ENSMUST00000097987 396 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Gm10583-201ENSMUST00000097988 396 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Gm6478-201ENSMUST00000099450 742 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 AC022682.1-201ENSMUST00000224624 2023 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Hmox1-201ENSMUST00000005548 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Gm42970-201ENSMUST00000196407 1352 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Gm8152-201ENSMUST00000120842 637 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Gm15658-201ENSMUST00000148293 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Gm30055-201ENSMUST00000203175 803 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Gm9736-201ENSMUST00000219969 834 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 5033404E19Rik-202ENSMUST00000194748 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Gm43997-201ENSMUST00000203986 1005 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 AC107752.1-201ENSMUST00000219362 469 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Tmem208-202ENSMUST00000098453 950 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Gm31138-201ENSMUST00000212296 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 Gm23132-201ENSMUST00000104254 132 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 Gm12736-201ENSMUST00000119330 236 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 Defa-ps17-201ENSMUST00000121849 171 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 Gm15540-201ENSMUST00000136052 674 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 1110020A21Rik-201ENSMUST00000181147 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 Gm26716-201ENSMUST00000181227 415 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 Gm7765-201ENSMUST00000182585 974 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms