Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms