Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Q9D7E4 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Q9D7E4 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Q9D7E4 Kif3c-201ENSMUST00000020999 6791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Q9D7E4 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Q9D7E4 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Q9D7E4 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Q9D7E4 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Q9D7E4 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Q9D7E4 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Q9D7E4 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Q9D7E4 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Q9D7E4 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Q9D7E4 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Q9D7E4 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Q9D7E4 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Q9D7E4 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Q9D7E4 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Q9D7E4 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Q9D7E4 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Q9D7E4 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Q9D7E4 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Q9D7E4 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Q9D7E4 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Q9D7E4 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Q9D7E4 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Q9D7E4 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q9D7E4 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q9D7E4 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q9D7E4 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q9D7E4 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q9D7E4 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q9D7E4 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q9D7E4 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q9D7E4 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q9D7E4 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q9D7E4 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Q9D7E4 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q9D7E4 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q9D7E4 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q9D7E4 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q9D7E4 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q9D7E4 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q9D7E4 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q9D7E4 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q9D7E4 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q9D7E4 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q9D7E4 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q9D7E4 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q9D7E4 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q9D7E4 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q9D7E4 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q9D7E4 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q9D7E4 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q9D7E4 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q9D7E4 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Q9D7E4 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Q9D7E4 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q9D7E4 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Q9D7E4 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Q9D7E4 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Q9D7E4 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q9D7E4 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q9D7E4 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q9D7E4 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q9D7E4 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Q9D7E4 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q9D7E4 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Q9D7E4 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q9D7E4 Epb41l5-202ENSMUST00000052404 6442 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q9D7E4 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q9D7E4 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q9D7E4 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q9D7E4 Tns3-201ENSMUST00000020695 7483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q9D7E4 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q9D7E4 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q9D7E4 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q9D7E4 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q9D7E4 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q9D7E4 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q9D7E4 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q9D7E4 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q9D7E4 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q9D7E4 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q9D7E4 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q9D7E4 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Q9D7E4 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Q9D7E4 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Q9D7E4 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Q9D7E4 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Q9D7E4 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Q9D7E4 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Q9D7E4 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Q9D7E4 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Q9D7E4 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Q9D7E4 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Q9D7E4 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Q9D7E4 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Q9D7E4 Dchs2-201ENSMUST00000191829 10783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Q9D7E4 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.9 ms