Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms