Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Gm12676-201ENSMUST00000149078 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Gm16240-201ENSMUST00000161924 614 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Gm4462-201ENSMUST00000166453 492 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Psme1-208ENSMUST00000174259 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Gm22903-201ENSMUST00000175193 102 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Gm25070-201ENSMUST00000175237 102 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Gm25299-201ENSMUST00000175283 102 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Gm23798-201ENSMUST00000175560 102 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Gm23802-201ENSMUST00000175565 102 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Gm25708-201ENSMUST00000177687 102 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Gm24370-201ENSMUST00000178007 102 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Gm23049-201ENSMUST00000178068 102 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Gm28019-201ENSMUST00000178138 101 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Gm25571-201ENSMUST00000178322 102 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Gm25355-201ENSMUST00000178456 101 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Gm24975-201ENSMUST00000178492 101 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Gm23189-201ENSMUST00000178954 102 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Gm25100-201ENSMUST00000179750 101 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Gm23064-201ENSMUST00000179866 101 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Abracl-203ENSMUST00000218994 425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 AC138716.2-201ENSMUST00000226670 1016 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Gm24279-201ENSMUST00000104236 131 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 7420461P10Rik-201ENSMUST00000169439 781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Mir3060-201ENSMUST00000175339 83 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 412 ms