Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms