Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.7 ms