Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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