Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
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