Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms